Das MLW ist ein Grundlagenforschungsprojekt an der Bayerischen Akademie der Wissenschaften und wird gefördert im Rahmen des Akademienprogramms von Bund und Ländern, ist jeweils zur Hälfte von der Akademienunion und dem Freistaat Bayern finanziert und wird geleitet von einem Projektausschuss und einem Projektbeirat, der diesen begleitet und berät.

Die Österreichische Akademie der Wissenschaften trägt zum Fortschritt des Wörterbuches durch die Finanzierung einer wissenschaftlichen Mitarbeiterstelle bei, die Schweizerische Akademie der Geistes- und Sozialwissenschaften entsendet auf ihre Kosten immer wieder Stipendiaten, die am MLW das Handwerk der Lexikographie erlernen können.

Das Projekt selbst wird von wissenschaftlichen Mitarbeiter(inne)n realisiert.